Un mecanismo recurrente en la reparación del DNA es el ilustrado por la DNA polimerasa I.
Un complejo proteico reconoce al defecto y recluta una endonucleasa que introduce una muesca al romper un enlace fosfodiester.
El DNA dañado es removido por la polimerasa o por exonucleasas
La DNA polimerasa lo rellena usando el extremo 3'OH disponible y hasta topar con el DNA sano.
La DNA ligasa sella la muesca para completar la reparación.