En los Eucariontes, el péptido señal es reconocido por una partícula ribonucleoproteína llamada Signal Recognition Particle o SRP, durante la traducción cuando el péptido apenas asoma del ribosoma.
Esta partícula interactúa con el ribosoma y detiene la traducción del mensaje, hasta que lleva la proteína hasta un receptor en el Retículo Endoplásmico.
Ahí el ribosoma se asocia a un complejo de translocación que inyecta el péptido en el canal y asocia el ribosoma a un receptor en la membrana. La traducción continua con el ribosoma adosado a la cara citoplásmica de la membrana de retículo y la proteína va ingresando al lumen del retículo mientras se traduce.