Un factor central de regulación es el NADH, que se acumula si la cadena respiratoria está detenida.
Además, la PDH es inactivada por fosforilación mediada por una CINASA DE PROTEÍNAS mitocondrial.
El nivel de Ca2+ mitocondrial puede contrarrestar este efecto, pero este nivel está controlado por una “conversación” entre mitocondria y citoplasma.