Académicos del Departamento

Facultad de Medicina, UNAM

Dra. Leticia Haydeé Ramírez Silva

Facultad de Medicina, 2º piso Torre de Investigación
Laboratorio de Péptidos y Proteínas.
Tel. +52 (55) 56232133

Estoy interesada en estudiar las diferentes propuestas que la piruvato cinasa ha encontrado para alcanzar su conformación activa durante la evolución. A partir del análisis filogenético de la familia de la piruvato cinasa hemos encontrado que la enzima se encuentra en dos grandes ramas. Una de estas está conformada por piruvato cinasas que dependen del K+ para expresar su actividad, mientras que la otra rama esta formada por enzimas independientes del catión. Entender el papel del catión monovalente en la rama de las enzimas dependientes y los mecanismos que utilizan aquellas enzimas independientes de él nos ha permitido entender como cataliza la piruvato cinasa en los diferentes dominios de la vida.

Experiencia Profesional

Trayectoria profesional

  • Profesor Titular “B” TC, SNI I, Facultad de Medicina (desde 2006)

Posdoctorados y estancias

  • Estancia en la universidad Federal de Rio de Janeiro (3.5 meses en 1992)
  • Estancia en la Universidad de Urbana, Il (6 meses en 2002)
  • Estancia en la Universidad de Notre Dame IN, Il (3 semanas en 1993)

Formación académica

  • Doctorado en Investigación Biomédica Básica (1990-1995), UNAM, Instituto de Fisiología Celular, México
  • Maestría en Ciencias Biomédicas (1986-1989), UNAM, Facultad de Medicina, México
  • Licenciatura en Biología (1977-1982), UAM-X, México.

Líneas de Investigación

  • Mecanismo cinético de la piruvato cinasa de músculo de conejo (RMPK) (dependiente de K+) en presencia de concentraciones saturantes del catión y en su ausencia; así como de otras piruvato cinasas independientes de K+.
  • Estudio filogenético del árbol dicotómico de la familia de la PK: la rama de las PKs dependientes de K+ que presentan la firma T113/K114/E117/T120 y la rama de las PKs independientes de K+ que presentan la firma L113/Q114/K117/(L,I,V) 120 (numeración de acuerdo con la RMPK).
  • Estudio de la caracterización cinética y estructural de la sustitución de la firma de las PKs dependientes por la firma de las independientes de K+. Es decir el estudio de las mutantes de RMPK:  K114Q, T120L, T113L/E117K, T113L/K114Q/E117K, K114Q/E117K/T120L y T113L/K114Q/E117K/T120L. 
  • Estudio de la caracterización cinética de 2 piruvato cinasas de Vibrio cholerae una presente en la rama dependiente de K+ y la otra en la rama independiente de K+.
  • Estudio de la caracterización cinética de la piruvato cinasa de la Crenarchaeota Thermophilum pendens (TpPK) que presenta V70 correspondiente a la posición 117 de RMPK.
  • Estudio de la caracterización fisicoquímica de la sustitución de las Phe del core hidrofóbico de la tapa de la TpPK por los residuos no polares alifáticos presentes en RMPK.
  • Estudio de la caracterización cinética de la piruvato cinasa de las mutantes V70E y V70K de la PK de Thermophilum pendens.
  • Estudio de la caracterización fisicoquímica de la piruvato cinasa de la Crenarchaeota Pyrobaculum aerophylum (PaPK) que presenta S85 correspondiente a la posición 117 de RMPK.

Premios y Distinciones

1995

Mención honorífica por estudios de Doctorado

Alumnos

Jesús Antonio Oria Hernández

Jesús Antonio Oria Hernández

Tesis de Doctorado

Gustavo De la Vega Ruíz

Gustavo De la Vega Ruíz

Tesis de Doctorado

Carlos Alberto Guerrero Mendiola

Carlos Alberto Guerrero Mendiola

Tesis de Doctorado

Citlaly Itzel Reyes García

Citlaly Itzel Reyes García

Tesis de Licenciatura

Paul Alejandro Gómez Coronado

Paul Alejandro Gómez Coronado

Tesis de Licenciatura

Erick Daniel Aguilar Vela

Erick Daniel Aguilar Vela

Tesis de Licenciatura

Cruz Alexis Ortíz Cruz

Cruz Alexis Ortíz Cruz

Tesis de Licenciatura

Alan Omar Lugo Munguía

Alan Omar Lugo Munguía

Tesis de Licenciatura

Ma. Fernanda Jácome Alba

Ma. Fernanda Jácome Alba

Tesis de Licenciatura

Mitchel Daniela Berman Flores

Mitchel Daniela Berman Flores

Tesis de Licenciatura

Zuribet Baxin Toto

Zuribet Baxin Toto

Tesis de Licenciatura

Publicaciones

Total sin duplicar: 182025 12024 12023 12022 12018 12017 12015 12014 22009 12008 12006 12005 12003 12001 11998 11997 11993 1

2025 (1)

  1. Ramírez-Silva L, Riveros-Rosas H, Hernández-Alcántara G, García-Trejo JJ, Vega-Segura A, González-Andrade M, Díaz-Salazar AJ, Salcedo-Barrientos G. The Functional State of Thermoplasma acidophilum Pyruvate Kinase Relies on an Extra Carboxyl-Terminal Sequence. International journal of molecular sciences. 2025;26(17). DOI · PubMed · PMID: 40943330

2024 (1)

  1. García-Trejo JJ, Rojas-Alcantar S, Alonso-Vargas M, Ortega R, Benítez-Guzmán A, Ramírez-Silva L, Pavón N, Peña-Segura C, Méndez-Romero O, Uribe-Carvajal S, Cadena-Ramírez A. A New Real-Time Simple Method to Measure the Endogenous Nitrate Reductase Activity (Nar) in Paracoccus denitrificans and Other Denitrifying Bacteria. International journal of molecular sciences. 2024;25(18). DOI · PubMed · PMID: 39337258

2023 (1)

  1. Mendoza-Hoffmann F, Yang L, Buratto D, Brito-Sánchez J, Garduño-Javier G, Salinas-López E, Uribe-Álvarez C, Ortega R, Sotelo-Serrano O, Cevallos MÁ, Ramírez-Silva L, Uribe-Carvajal S, et al.. Inhibitory to non-inhibitory evolution of the ζ subunit of the F(1)F(O)-ATPase of Paracoccus denitrificans and α-proteobacteria as related to mitochondrial endosymbiosis. Frontiers in molecular biosciences. 2023;10:1184200. DOI · PubMed · PMID: 37664184

2022 (1)

  1. Ramírez-Silva L, Hernández-Alcántara G, Guerrero-Mendiola C, González-Andrade M, Rodríguez-Romero A, Rodríguez-Hernández A, Lugo-Munguía A, Gómez-Coronado PA, Rodríguez-Méndez C, Vega-Segura A. The K(+)-Dependent and -Independent Pyruvate Kinases Acquire the Active Conformation by Different Mechanisms. International journal of molecular sciences. 2022;23(3). DOI · PubMed · PMID: 35163274

2018 (1)

  1. Alba-Martínez Z, Ramírez-Silva L, Hernández-Alcántara G. Exploring the differences between the three pyruvate kinase isozymes from Vibrio cholerae in a heterologous expression system. BMC research notes. 2018;11(1):527. DOI · PubMed · PMID: 30064476

2017 (1)

  1. Guerrero-Mendiola C, García-Trejo JJ, Encalada R, Saavedra E, Ramírez-Silva L. The contribution of two isozymes to the pyruvate kinase activity of Vibrio cholerae: One K+-dependent constitutively active and another K+-independent with essential allosteric activation. PloS one. 2017;12(7):e0178673. DOI · PubMed · PMID: 28686591

2015 (1)

  1. De la Vega-Ruíz G, Domínguez-Ramírez L, Riveros-Rosas H, Guerrero-Mendiola C, Torres-Larios A, Hernández-Alcántara G, García-Trejo JJ, Ramírez-Silva L. New insights on the mechanism of the K(+-) independent activity of crenarchaeota pyruvate kinases. PloS one. 2015;10(3):e0119233. DOI · PubMed · PMID: 25811853

2014 (2)

  1. Ramírez-Silva L, Guerrero-Mendiola C, Cabrera N. The importance of polarity in the evolution of the K+ binding site of pyruvate kinase. International journal of molecular sciences. 2014;15(12):22214-26. DOI · PubMed · PMID: 25474090
  2. Zarco-Zavala M, Morales-Ríos E, Mendoza-Hernández G, Ramírez-Silva L, Pérez-Hernández G, García-Trejo JJ. The ζ subunit of the F1FO-ATP synthase of α-proteobacteria controls rotation of the nanomotor with a different structure. FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology. 2014;28(5):2146-57. DOI · PubMed · PMID: 24522203

2009 (1)

  1. Guerrero-Mendiola C, Oria-Hernández J, Ramírez-Silva L. Kinetics of the thermal inactivation and aggregate formation of rabbit muscle pyruvate kinase in the presence of trehalose. Archives of biochemistry and biophysics. 2009;490(2):129-36. DOI · PubMed · PMID: 19703407

2008 (1)

  1. José-Nuñez C, Torres-Larios A, Ramírez-Silva L, Mendoza G, Salcedo G, Gómez-Puyou A, Tuena de Gómez-Puyou M. Catalysis by isolated beta-subunits of the ATP Synthase/ATPase from Thermophilic bacillus PS3. Hydrolysis of pyrophosphate. Journal of bioenergetics and biomembranes. 2008;40(6):561-8. DOI · PubMed · PMID: 19139978

2006 (1)

  1. Oria-Hernández J, Riveros-Rosas H, Ramírez-Sílva L. Dichotomic phylogenetic tree of the pyruvate kinase family: K+ -dependent and -independent enzymes. The Journal of biological chemistry. 2006;281(41):30717-24. DOI · PubMed · PMID: 16905543

2005 (1)

  1. Oria-Hernández J, Cabrera N, Pérez-Montfort R, Ramírez-Silva L. Pyruvate kinase revisited: the activating effect of K+. The Journal of biological chemistry. 2005;280(45):37924-9. DOI · PubMed · PMID: 16147999

2003 (1)

  1. Ramírez-Silva L, Oria-Hernández J. Selectivity of pyruvate kinase for Na+ and K+ in water/dimethylsulfoxide mixtures. European journal of biochemistry. 2003;270(11):2377-85. DOI · PubMed · PMID: 12755692

2001 (1)

  1. Ramírez-Silva L, Ferreira ST, Nowak T, Tuena de Gómez-Puyou M, Gómez-Puyou A. Dimethylsulfoxide promotes K+-independent activity of pyruvate kinase and the acquisition of the active catalytic conformation. European journal of biochemistry. 2001;268(11):3267-74. DOI · PubMed · PMID: 11389729

1998 (1)

  1. Saavedra-Lira E, Ramirez-Silva L, Perez-Montfort R. Expression and characterization of recombinant pyruvate phosphate dikinase from Entamoeba histolytica. Biochimica et biophysica acta. 1998;1382(1):47-54. DOI · PubMed · PMID: 9507062

1997 (1)

  1. Ramírez-Silva L, Oria J, Gómez-Puyou A, Tuena de Gómez-Puyou M. The contribution of water to the selectivity of pyruvate kinase for Na+ and K+. European journal of biochemistry. 1997;250(2):583-9. DOI · PubMed · PMID: 9428713

1993 (1)

  1. Ramírez-Silva L, de Gómez-Puyou MT, Gómez-Puyou A. Water-induced transitions in the K+ requirements for the activity of pyruvate kinase entrapped in reverse micelles. Biochemistry. 1993;32(20):5332-8. DOI · PubMed · PMID: 8499438
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