Académicos del Departamento

Facultad de Medicina, UNAM

Alejandro Sosa Peinado

Dr. Alejandro Sosa Peinado

Dr. Alejandro Sosa Peinado

Dep. Bioquímica, Facultad de Medicina
Laboratorio de Fisicoquímica e Ingeniería de Proteína
Torre de Investigación 2er piso
Universidad Nacional Autónoma de México, UNAM
Cd. Universitaria, Coyoacán, México D.F. 04510
(525) 623 2275 / 59

Profesor Titular «B» de Tiempo Completo
Departamento de Bioquímica, Facultad de Medicina, UNAM
SNI I

El Dr. Alejandro Sosa Peinado obtuvo su doctorado en Investigación Biomédica Básica por la UNAM y realizó estancias postdoctorales en The Chicago Medical School y The University of Chicago. Su investigación se centra en el estudio de las relaciones estructura-función de proteínas mediante técnicas experimentales y computacionales, incluyendo dinámica conformacional, interacciones proteína-ligando, desarrollo de biosensores fluorescentes y modelaje molecular con AMBER y GROMACS. Ha publicado 46 artículos en revistas internacionales arbitradas, obtenido una patente internacional de biosensor de calmodulina y dirigido 18 tesis de licenciatura, maestría y doctorado. Es socio fundador de la Rama de Fisicoquímica e Ingeniería de Proteínas de la Sociedad Mexicana de Bioquímica y ha impartido cursos de licenciatura y posgrado en bioquímica, fisicoquímica de proteínas y modelaje molecular desde el año 2000.

Líneas de Investigación

  • Dinámica Conformacional de Proteínas – Estudio de movimientos moleculares y cambios conformacionales mediante señales espectroscópicas y simulaciones de dinámica molecular
  • Interacciones Proteína-Ligando – Caracterización fisicoquímica de la unión de ligandos, incluyendo el diseño racional de nuevas especificidades
  • Desarrollo de Biosensores Fluorescentes – Creación de herramientas de detección basadas en proteínas marcadas con sondas fluorescentes
  • Modelaje y Simulación Molecular – Aplicación de dinámica molecular con AMBER, GROMACS y otras plataformas para correlacionar estructura, dinámica y función

Docencia

Licenciatura:

  • Bioquímica y Biología Molecular, Facultad de Medicina, UNAM (2000-presente)
  • Taller «De los Genes a la Función de las Proteínas», Facultad de Ciencias, UNAM

Posgrado:

  • Fisicoquímica de Proteínas I
  • Principios Prácticos del Modelaje Molecular
  • Herramientas de Modelaje Molecular Aplicadas a las Interacciones Biomoleculares
  • Información Evolutiva y Estructural en el Análisis de Proteínas

Publicaciones

Total sin duplicar: 282026 32025 12024 12023 12022 22020 12019 12018 12017 22016 22015 22014 22013 12011 32010 12009 22005 12002 1

2026 (3)

  1. González-Andrade M, Lizárraga-Valadez RA, Sosa-Peinado A, Cortés-Benítez F, Vasquez-Martínez N. Uncompetitive Allosteric Inhibition of PTP1B by BP-1-102 Reveals a Potential Dual-Target Strategy toward the PTP1B-STAT3 Oncogenic Axis: Biochemical and Computational Evidence. ACS medicinal chemistry letters. 2026;17(7):1440-1447. DOI · PubMed · PMID: 42445032
  2. González-Andrade M, Gijsbers A, Sosa-Peinado A, Vasquez-Martínez N. Rational design framework for fluorescent biosensors from periplasmic binding proteins. Bioscience reports. 2026;46(5). DOI · PubMed · PMID: 41983621
  3. Vasquez-Martínez N, Trapala J, Álvarez-Añorve LI, Lizárraga-Valadez RA, González-Andrade M, Sosa-Peinado A. GPU-Accelerated Virtual Screening and Molecular Dynamics Simulations for Identification of Novel DPP‑4 Inhibitors. ACS omega. 2026;11(4):5323-5338. DOI · PubMed · PMID: 41658155

2025 (1)

  1. López S, Rojo-Domínguez A, López-Simeon R, Sosa-Peinado A, Nájera H. L-tyrosine inhibits the formation of amyloid fibers of human lysozyme at physiological pH and temperature. Amino acids. 2025;57(1):15. DOI · PubMed · PMID: 39955695

2024 (1)

  1. Coronell-Tovar A, Pardo JP, Rodríguez-Romero A, Sosa-Peinado A, Vásquez-Bochm L, Cano-Sánchez P, Álvarez-Añorve LI, González-Andrade M. Protein tyrosine phosphatase 1B (PTP1B) function, structure, and inhibition strategies to develop antidiabetic drugs. FEBS letters. 2024;598(15):1811-1838. DOI · PubMed · PMID: 38724486

2023 (1)

  1. Vergara R, Berrocal T, Juárez Mejía EI, Romero-Romero S, Velázquez-López I, Pulido NO, López Sanchez HA, Silva DA, Costas M, Rodríguez-Romero A, Rodríguez-Sotres R, Sosa-Peinado A, et al.. Thermodynamic and kinetic analysis of the LAO binding protein and its isolated domains reveal non-additivity in stability, folding and function. The FEBS journal. 2023;290(18):4496-4512. DOI · PubMed · PMID: 37178351

2022 (2)

  1. Sosa-Peinado A, Fructuoso-García K, Vásquez-Bochm LX, González-Andrade M. Bisindolylmaleimides New Ligands of CaM Protein. Molecules (Basel, Switzerland). 2022;27(21). DOI · PubMed · PMID: 36363988
  2. Sosa-Peinado A, León-Cruz E, Velázquez-López I, Matuz-Mares D, Cano-Sánchez P, González-Andrade M. Theoretical-experimental studies of calmodulin-peptide interactions at different calcium equivalents. Journal of biomolecular structure & dynamics. 2022;40(6):2689-2700. DOI · PubMed · PMID: 33124950

2020 (1)

  1. Vergara R, Romero-Romero S, Velázquez-López I, Espinoza-Pérez G, Rodríguez-Hernández A, Pulido NO, Sosa-Peinado A, Rodríguez-Romero A, Fernández-Velasco DA. The interplay of protein-ligand and water-mediated interactions shape affinity and selectivity in the LAO binding protein. The FEBS journal. 2020;287(4):763-782. DOI · PubMed · PMID: 31348608

2019 (1)

  1. Reus-Chavarría E, Martínez-Vieyra I, Salinas-Nolasco C, Chávez-Piña AE, Méndez-Méndez JV, López-Villegas EO, Sosa-Peinado A, Cerecedo D. Enhanced expression of the Epithelial Sodium Channel in neutrophils from hypertensive patients. Biochimica et biophysica acta. Biomembranes. 2019;1861(2):387-402. DOI · PubMed · PMID: 30423324

2018 (1)

  1. Banda-Vázquez J, Shanmugaratnam S, Rodríguez-Sotres R, Torres-Larios A, Höcker B, Sosa-Peinado A. Redesign of LAOBP to bind novel l-amino acid ligands. Protein science : a publication of the Protein Society. 2018;27(5):957-968. DOI · PubMed · PMID: 29524280

2017 (2)

  1. Maya-Bernal JL, Ávila A, Ruiz-Gayosso A, Trejo-Fregoso R, Pulido N, Sosa-Peinado A, Zúñiga-Sánchez E, Martínez-Barajas E, Rodríguez-Sotres R, Coello P. Expression of recombinant SnRK1 in E. coli. Characterization of adenine nucleotide binding to the SnRK1.1/AKINβγ-β3 complex. Plant science : an international journal of experimental plant biology. 2017;263:116-125. DOI · PubMed · PMID: 28818366
  2. Velázquez-López I, León-Cruz E, Pardo JP, Sosa-Peinado A, González-Andrade M. Development of new hCaM-Alexa Fluor(®) biosensors for a wide range of ligands. Analytical biochemistry. 2017;516:13-22. DOI · PubMed · PMID: 27744023

2016 (2)

  1. Cerecedo D, Martínez-Vieyra I, Sosa-Peinado A, Cornejo-Garrido J, Ordaz-Pichardo C, Benítez-Cardoza C. Alterations in plasma membrane promote overexpression and increase of sodium influx through epithelial sodium channel in hypertensive platelets. Biochimica et biophysica acta. 2016;1858(8):1891-903. DOI · PubMed · PMID: 27137675
  2. González-Andrade M, Rodríguez-Sotres R, Madariaga-Mazón A, Rivera-Chávez J, Mata R, Sosa-Peinado A, Del Pozo-Yauner L, Arias-Olguín II. Insights into molecular interactions between CaM and its inhibitors from molecular dynamics simulations and experimental data. Journal of biomolecular structure & dynamics. 2016;34(1):78-91. DOI · PubMed · PMID: 25702612

2015 (2)

  1. Martínez-González JJ, Guevara-Flores A, Rendón JL, Sosa-Peinado A, Del Arenal Mena IP. Purification and characterization of Taenia crassiceps cysticerci thioredoxin: insight into thioredoxin-glutathione-reductase (TGR) substrate recognition. Parasitology international. 2015;64(2):194-201. DOI · PubMed · PMID: 25523293
  2. Pulido NO, Silva DA, Tellez LA, Pérez-Hernández G, García-Hernández E, Sosa-Peinado A, Fernández-Velasco DA. On the molecular basis of the high affinity binding of basic amino acids to LAOBP, a periplasmic binding protein from Salmonella typhimurium. Journal of molecular recognition : JMR. 2015;28(2):108-16. DOI · PubMed · PMID: 25604964

2014 (2)

  1. Avila-Castañeda A, Gutiérrez-Granados N, Ruiz-Gayosso A, Sosa-Peinado A, Martínez-Barajas E, Coello P. Structural and functional basis for starch binding in the SnRK1 subunits AKINβ2 and AKINβγ. Frontiers in plant science. 2014;5:199. DOI · PubMed · PMID: 24904601
  2. Domínguez L, Sosa-Peinado A, Hansberg W. How catalase recognizes H₂O₂ in a sea of water. Proteins. 2014;82(1):45-56. DOI · PubMed · PMID: 23818262

2013 (1)

  1. González-Andrade M, Del Valle P, Macías-Rubalcava ML, Sosa-Peinado A, Del Carmen González M, Mata R. Calmodulin inhibitors from Aspergillus stromatoides. Chemistry & biodiversity. 2013;10(3):328-37. DOI · PubMed · PMID: 23495150

2011 (3)

  1. Silva DA, Domínguez-Ramírez L, Rojo-Domínguez A, Sosa-Peinado A. Conformational dynamics of L-lysine, L-arginine, L-ornithine binding protein reveals ligand-dependent plasticity. Proteins. 2011;79(7):2097-108. DOI · PubMed · PMID: 21538545
  2. Gonzalez-Andrade M, Rivera-Chavez J, Sosa-Peinado A, Figueroa M, Rodriguez-Sotres R, Mata R. Development of the fluorescent biosensor hCalmodulin (hCaM)L39C-monobromobimane(mBBr)/V91C-mBBr, a novel tool for discovering new calmodulin inhibitors and detecting calcium. Journal of medicinal chemistry. 2011;54(11):3875-84. DOI · PubMed · PMID: 21495717
  3. Figueroa M, González-Andrade M, Sosa-Peinado A, Madariaga-Mazón A, Del Río-Portilla F, González Mdel C, Mata R. Fluorescence, circular dichroism, NMR, and docking studies of the interaction of the alkaloid malbrancheamide with calmodulin. Journal of enzyme inhibition and medicinal chemistry. 2011;26(3):378-85. DOI · PubMed · PMID: 20939762

2010 (1)

  1. Domínguez L, Sosa-Peinado A, Hansberg W. Catalase evolved to concentrate H2O2 at its active site. Archives of biochemistry and biophysics. 2010;500(1):82-91. DOI · PubMed · PMID: 20494646

2009 (2)

  1. González-Andrade M, Figueroa M, Rodríguez-Sotres R, Mata R, Sosa-Peinado A. An alternative assay to discover potential calmodulin inhibitors using a human fluorophore-labeled CaM protein. Analytical biochemistry. 2009;387(1):64-70. DOI · PubMed · PMID: 19185562
  2. Figueroa M, González Mdel C, Rodríguez-Sotres R, Sosa-Peinado A, González-Andrade M, Cerda-García-Rojas CM, Mata R. Calmodulin inhibitors from the fungus Emericella sp. Bioorganic & medicinal chemistry. 2009;17(6):2167-74. DOI · PubMed · PMID: 19013822

2005 (1)

  1. Sosa-Peinado A, González-Andrade M. Site-directed fluorescence labeling reveals differences on the R-conformer of glucosamine 6-phosphate deaminase of Escherichia coli induced by active or allosteric site ligands at steady state. Biochemistry. 2005;44(46):15083-92. DOI · PubMed · PMID: 16285712

2002 (1)

  1. Bustos-Jaimes I, Sosa-Peinado A, Rudiño-Piñera E, Horjales E, Calcagno ML. On the role of the conformational flexibility of the active-site lid on the allosteric kinetics of glucosamine-6-phosphate deaminase. Journal of molecular biology. 2002;319(1):183-9. DOI · PubMed · PMID: 12051945
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