α
α/β
α+β
Sin embargo, no todas las proteínas tienen un patrón simple de plegamiento terciario.
Hay muchas que se pliegan por regiones, es decir, un segmento de la cadena se pliega, relativamente separado del otro y, luego, se asocian para formar el conjunto final.
Decimos que estas proteínas son MULTIDOMINIO.
Cada subconjunto de la estructura es un dominio y cada dominio puede pertenecer a una clase distinta.
En este ejemplo correspondiente a una parte del complejo respiratorio de una bacteria hipertermofílica (pdbid 2FUG), el dominio N-terminal posee una estructura tipo α/β, un dominio central es de tipo α+β y el dominio C-terminal es α.